Walczyłem z tym problemem i już prawie miałem, gdzie tkwi problem. Niestety poległem.
Dzisiaj ponowiłem próby zwalczenia problemu, klikałem przeszło 2h w ustawieniach wydruków PDF, ale płatnik był cały czas nie ugięty. Drukował albo jedną stronę, albo tylko ramki deklaracji. Po obiedzie naszła refleksja i ponowne podejście do tematu. U mnie na serwerze Windows 2008 z terminalami działa tylko i wyłącznie dla następujących ustawień preferencji drukowania sterownika PDFCreator. Jak na obrazkach poniżej.

Zdaje się, że jest za to odpowiedzialny parametr Zaawansowane funkcje drukowania. Przynajmniej zmiana tego parametru powoduje drukowania normalne lub z kwadratami.
Dodatkowo w przypadku PDFCreatora także musi być zgodna ustawienie papieru w ustawieniach samego PDFCreatora.

Na koniec pozostaje mi tylko dodać, te dokładnie tak samo zachowuje się sterownik BullZip PDF Printer. Wykonanie ustawień jak na screenach powyżej daje pożądany efekt.
Problem z drukowaniem do PDFów z Płatnika występuje od wersji 8. Słyszałem także, że problem może dotyczyć niektórych drukarek HP, które są ustawione do druku zgodnego z PS (PostScript). U mnie wszystkie drukarki są w PCLu, więc może to mnie uratowało. Podobno w ZUSie można wysępić DLLkę, która poprawia problem z HP.